home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00222 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.0 KB  |  41 lines
  1. **********************************************************
  2. * Platelet-derived growth factor (PDGF) family signature *
  3. **********************************************************
  4.  
  5. Platelet-derived growth factor (PDGF) [1,2] is a potent mitogen  for  cells of
  6. mesenchymal  origin,  including  smooth  muscle  cells and glial  cells.  PDGF
  7. consists of  two  different  but closely related chains (A and B chains) which
  8. assemble  to form  disulfide  linked homo- or heterodimers (A-A, B-B, an A-B).
  9. Alternate splicing of the A chain  transcript  can give rise to  two different
  10. forms that differ only in their C-terminal extremity. The transforming protein
  11. of simian sarcoma virus (SSV), encoded by the v-sis oncogene,  is derived from
  12. the B chain of PDGF.
  13.  
  14. Vascular endothelial growth factor (VEGF), also known as vascular permeability
  15. factor (VPF)  [3,4], is a growth factor active in angiogenesis and endothelial
  16. cell growth.  Structurally VEGF is a disulfide-linked homodimer.  The sequence
  17. of the VEGF chain is related to that of the chains of PDGF.
  18.  
  19. As a signature pattern for this family of growth factors, we selected a region
  20. that include four of  the eight  cysteines conserved in the sequences of these
  21. proteins. In  PDGF,  these  cysteines  are  known to be involved in intra- and
  22. inter-chain disulfide bonds [5].
  23.  
  24. -Consensus pattern: C-V-x(3)-R-C-x-G-C-C-N
  25.                     [The four C's are involved in disulfide bonds]
  26. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  27. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  28. -Last update: December 1992 / Text revised.
  29.  
  30. [ 1] Hannink M., Donoghue D.J.
  31.      Biochim. Biophys. Acta 989:1-10(1989).
  32. [ 2] Heldin C.-H.
  33.      EMBO J. 11:4251-4259(1992).
  34. [ 3] Lewung D.W., Cachianes G., Kuang W.-J., Goeddel D.V., Ferrara N.
  35.      Science 246:1306-1309(1989).
  36. [ 4] Keck P.J., Hauser S.D., Krivi G., Sanzo K., Warren T., Feder J.,
  37.      Connolly D.T.
  38.      Science 246:1309-1312(1989).
  39. [ 5] Oefner C., d'Arcy A., Winkler F.K., Eggimann B., Hosang M.
  40.      EMBO J. 11:3921-3926(1992).
  41.